Damit Mehl lange frisch bleibt und seine Backeigenschaften erhält, sollte es trocken, dunkel und kühl gelagert werden, am besten in einem luftdichten Behälter. Helle Mehle wie Weizen Type 405 oder 550 sind bei richtiger Lagerung in der Regel ca. 12 bis 18 Monate haltbar, behalten aber die beste Backqualität, wenn sie frisch verwendet werden. Vollkornmehle und Dinkel-Vollkornmehle enthalten mehr Fett und Ballaststoffe, wodurch sie schneller ranzig werden. Sie halten in der Regel ca. 3 bis 6 Monate – hier empfiehlt sich eine kühle und luftdichte Lagerung. Glutenfreie Mehle sind je nach Sorte meist ca. 6 bis 12 Monate haltbar. Nuss- und Samenmehle sollten besonders kühl und luftdicht aufbewahrt und in der Regel innerhalb von ca. 3 bis 6 Monaten verbraucht werden, da sie besonders empfindlich auf Wärme, Feuchtigkeit und Oxidation reagieren.